基础与转化医学研究中心团队成员


 

  孙逸仙纪念医院基础与转化医学研究中心由专职研究人员、实验室管理员和技术人员共同组成。

 


 

专职研究人员:

基础与转化医学研究中心PI:尹东罗曼莉郭雅彬覃海德黄炳培许小丁蔡佩娥蒋琳加潘越鲍燕林伟杰赵慧英李璐周一鸣刘兆宇曹春伟黄林陈思凡吴柏星苏媛媛朱亚锋廖新勤  【 浏览PI信息概览表 】

研究员:尹东(主任)郭雅彬覃海德蒋琳加黄炳培许小丁蔡佩娥潘越李璐周一鸣黄林陈思凡

副研究员:罗曼莉(副主任)廖建友(生物信息中心主任)鲍燕林伟杰赵慧英刘兆宇曹春伟吴柏星胡开顺苏媛媛朱亚锋廖新勤

助理研究员:郑芳朱英华何洁华张寅、徐康

 

 

实验室管理及技术人员:

副主任技师:魏菁

主管技师:梁蔚文苏芳邓伟溪

技师:邵静林燕华

助理实验师:姚伟城王永强、王小娟、岑美凤、谯田、杨兵、文雪梅

 

 

    基础与转化医学研究中心PI信息概览

 

PI

研究方向和内容

疾病模型和临床转化

尹东

1)肿瘤的分子遗传:利用肿瘤全基因组芯片和测序技术,扫描筛选癌症相关基因,研究其表达调控机制和肿瘤学功能及在诊断治疗中的应用;(2) 肿瘤功能蛋白质:转录后修饰和蛋白质翻译后修饰的调控与肿瘤关系的研究。RBP-RNA-DNA作用网络对基因表达的调控;(3) 抗肿瘤小分子药物:DNA损伤类小分子抗肿瘤药物的细胞生物学机制。DNA损伤修复过程中的染色质重塑、转录抑制和细胞周期,揭示小分子药物的抗肿瘤机制。

*恶性肿瘤:包括乳腺癌、肝癌、脑癌等。*动物模型:小鼠原位成瘤和皮下成瘤模型。*细胞模型:肿瘤原代细胞和细胞系。细胞周期和DNA损伤研究方法。*分子生物学:基因克隆和表达、DNA+RNA+蛋白质之间的相互作用和定性定量检测。

罗曼莉

长非编码RNA在肿瘤细胞信号通路转导中的作用和机制研究。

肿瘤,乳腺癌模型为主。

郭雅彬

1)用高通量、多组学的方法研究转座子,重点是人类内源性逆转座子LINE-1;(2CRISPR基因编辑技术的应用;(3)肿瘤基因组学。

1)人类内源性转座子LINE-1在人类早期胚胎发育中的作用;(2)三代试管婴儿早期胚胎质量的转录组研究;(3CRISPR基因编辑技术矫正单基因遗传病的探索。

覃海德

基因组学、生物信息学。

(1)膀胱癌分子分型、智能诊断及新治疗靶点的发现;(2)鼻咽癌、食道癌、及泛癌种(Pan-Cancer)新治疗靶点的基础研究。

黄炳培

肿瘤血管调控促肿瘤生長,免疫抑制和耐药微环境。

推进靶向肿瘤耐药微环境治疗方法的应用;构建数字化精准医疗多重组学整合平台;利用多种癌症动物模型及类器官测试新研发的靶向药物治疗效果,坚定贯彻肿瘤微环境的多学科联合和精准化治疗措施。

许小丁

肿瘤靶向治疗。

小鼠肿瘤模型、转化纳米医学。

蔡佩娥

1)筛选新型高效肿瘤靶向配体,深入研究新型肿瘤靶向配体修饰的纳米药物输送体系在肿瘤靶向治疗上的应用;(2) 开发生物安全的新型纳米输送体系用于输送小分子干扰RNAsiRNA)和癌症靶向治疗;(3) 改进传统纳米药物输送体系,提出肿瘤微环境响应的智能高分子聚前药(Polyprodrug)的概念,系统研究智能高分子聚前药纳米输送体系在肿瘤靶向治疗上的应用。

基于恶性肿瘤的皮下移植瘤模型,原位瘤模型,PDX模型及体外模型进行纳米载体的抗肿瘤作用的探索与评估。通过包载不同的治疗介质,尤其是siRNAmRNAlncRNA,质粒等特异性强但体内稳定性差,难以成药的治疗介质,从而构建肿瘤靶向性强,体内稳定性好,全身副作用小的安全,高效的抗肿瘤纳米药物,使诸多机制学研究成果得以实现临床转化。

蒋琳加

1)利用微环境信号促进正常造血干细胞扩增:造血干细胞是临床上治疗多种疾病的细胞来源,然而其自我更新和分化的信号调控网络尚不明确,导致无法规模化扩增。骨髓微环境信号对HSC稳态下的静息期维持以及放、化疗损伤后HSC的再生修复有重要调控作用。我们将从微环境角度,研究调控干细胞自我更新的信号通路,并利用人脐血HSC探讨造血干细胞体外扩增的优化方案;2)白血病干细胞的靶向治疗:造血干细胞移植、放疗及化疗是临床上治疗急性白血病的有效方法,但是治疗后疾病的复发是亟待解决的临床问题,其根本原因是治疗后的少数白血病干细胞在体内微环境的支持下长期生存和扩增。我们将利用多种特异性标记白血病和微环境细胞的小鼠模型来研究白血病干细胞和微环境的相互关系,通过干扰微环境清除白血病干细胞从而达到治愈疾病的目的;3)听毛细胞再生:哺乳动物的听毛细胞在损伤后不能再生,这是导致许多听力疾病发生的根本原因,然而斑马鱼具有很强的再生能力,在短期内能够完成听毛细胞的再生。我们利用全基因组RNA测序的方法第一次全面研究了班马鱼听毛细胞再生过程中的基因和信号通路变化,并进一步阐明Wnt, Notch, Bmp等信号通路相互作用和功能。目前的工作重点是通过功能基因组学的方法针对RNA测序中发现的重要基因筛查对斑马鱼听毛细胞再生的影响,并进一步在小鼠模型中验证其功能。

*疾病模型:(1)造血干细胞的损伤和再生模型,造血干细胞移植模型,髓系和淋系的小鼠白血病模型;(2)斑马鱼的听毛细胞损伤和再生模型,斑马鱼的基因敲除和转基因系的构建;(3)小鼠的人源异种移植模型,斑马鱼的人源异种移植模型。*临床转化:(1)研究促进造血干细胞体外扩增的培养体系,研究白血病化疗耐药和复发的机制和药物靶点;(2)斑马鱼模型适合于做活体的高通量药物筛选,利用听毛细胞损伤和再生的斑马鱼模型研发保护损伤和促进再生的药物靶点;(3)利用肿瘤病人细胞的斑马鱼移植模型进行临床前的药物评估及联合治疗的方案优化。

潘越

*研究方向:生物医学工程。*研究内容:RNA递送,多模态影像,协同治疗。

*疾病模型:肿瘤。*临床转化:造影剂。

鲍燕

发展治疗细菌感染性疾病的新策略,提高细菌感染性疾病治疗疗效,克服细菌的耐药问题并降低药物毒副作用。

各种细菌感染性疾病模型,开发高效杀菌且低毒的抗菌材料用于治疗细菌感染性疾病。

林伟杰

1)退行性神经疾病相关致病机制;(2)放射治疗引发慢性脑损伤相关炎性致病机制;(3)神经肽对保护认知和稳定情绪功能的分子作用机制。

使用小鼠动物模型进一步研究老年痴呆症及放射性脑损伤引發大脑免疫炎性反应和神经功能损伤的相关机制,并结合行为学、神经环路调控和分子生物学等多层次研究手段,分析临床病理组织的细胞分子变化,探讨神经疾病的生化分子机制以发展有效疾病防治策略。

赵慧英

生物医学大数据研究。

1)心脏病、神经退行性疾病,及肿瘤;(2)疾病预警模型。

李璐

神经科学。*研究内容:脑认知与疾病的回路与分子机制。

1)抑郁样行为的神经机制与新药靶点;(2)神经可塑性;(3)可用于神经科学与医学研究的智能工具等。

周一鸣

1)离子通道在代谢性疾病中的参与机制;(2)建立临床免疫细胞单细胞图谱,探讨免疫细胞在自身免疫性疾病中的参与机制。

*动物模型:糖尿病,高血压,肥胖,慢性肾病等小鼠模型。*临床转化:寻找代谢及免疫性疾病中可能的靶点。

刘兆宇

*研究方向:心血管与代谢性疾病的分子机制和靶向治疗。*研究内容:血管组成细胞和外周脂肪与免疫细胞在心血管疾病和代谢性疾病中的作用,探索靶向干预治疗的潜在方法。

*疾病模型:动脉粥样硬化、动脉瘤、高血压、血管新生、胰岛素抵抗和糖尿病。*临床转化:功能分子在疾病中的诊断和治疗潜能。

曹春伟

*研究方向:主要从事医学遗传学、疾病基因组学和疾病动物模型方向的研究工作。*研究内容:(1)早期胚胎发育调控,包括母源因子缺陷导致胚胎停育的分子机制,以及哺乳动物早期胚胎发育的表观遗传学调控机制研究;(2)单基因遗传病致病基因挖掘和机制解析,包括利用高通量测序技术挖掘和定位单基因遗传病的致病基因和突变,并通过体内和体外实验解析致病分子机制;(3)生物医学研究的动物模型构建,通过化学诱变和基因编辑工具进行疾病动物模型的构建。

目前构建的动物模型(中科院动物所工作期间研究成果)包括:(1)甲状腺功能减退大动物模型:通过ENU化学诱变创制的DUOX2基因突变猪动物模型,该模型表现严重的甲减和贫血,研究发现TR-KLF9轴是甲减引起贫血的分子通路,KLF9为潜在的治疗靶点;(2)小丑鱼鳞癣大动物模型:通过ENU化学诱变创制的ABCA12基因突变猪动物模型,较之小鼠模型,该模型能够较好模拟人类疾病表型,是开展基因治疗和药物筛选研究的合适动物模型。

黄林

1)微生物尤其是致病微生物中非编码RNA的结构与功能;2)非编码RNA在特定疾病的发生和发展过程中的作用及分子机制;3)生物信息RNA结构建模:深入理解不同的RNA结构模体(motif)。

1)肠道菌,艰难梭菌,抗生素开发; (2)乳腺癌 lncRNA MLATA1

陈思凡

*研究方向:2型糖尿病及其并发症的分子机制及防治。*研究内容:(1)研究肠道菌群对2型糖尿病及其并发症的调控;(2)研究Sirtuins在胰岛素抵抗相关代谢性疾病中的表观遗传学调控。

*疾病模型:炎症、胰岛素抵抗相关的慢性代谢性疾病如肥胖、2型糖尿病、动脉粥样硬化等。*临床转化:通过研究肠道菌群或Sirtuins2型糖尿病糖脂代谢的调控机制,筛选出新型的肠菌代谢产物作为糖尿病及其并发症的血清标志物,针对特异的肠菌代谢产物或Sirtuins进行特异性激活或抑制剂的开发,以用于临床疾病的药物防治。

吴柏星

*研究方向:主要从事核酸相关蛋白的结构生物学研究。*研究内容:利用X-射线晶体学以及Cryo-EM技术,结合生物化学与分子生物学方法;(1)研究核酸修饰相关识别因子的结构,如m6Am5Cac4C等修饰的的识别与催化机制;(2)同时也研究与重要疾病相关的RNA结合蛋白(如渐冻人症)以及与非编码RNA生成相关的RNA结合蛋白的结构与功能;(3)另外也对DNA复制与损伤修复相关蛋白复合物的结构生物学研究,阐明真核生物DNA复制相关蛋白质机器的工作机理。

1)线粒体,线粒体疾病药物筛选; (2)乳腺癌 lncRNA DOCK1; (3)渐冻人症,淀粉样蛋白清除。

廖建友研究方向:(1)RNA结合蛋白和小肽促进肿瘤生长的功能和机制研究;(2)非编码RNA鉴定算法开发和数据库构建;(3)表观遗传与肿瘤。*疾病模型:乳腺癌和肝癌为主。
胡开顺(1)肿瘤重要蛋白的翻译后修饰鉴定与功能研究;(2)DNA双链断裂修复的机制与癌症发生及治疗。*细胞模型:放化疗诱导细胞耐药,DNA损伤诱导转录抑制细胞模型(U2OS-263,U2OS-265),DNA损伤修复通路检测细胞模型(DR-GFP,EJ5-GFP,EJ2-GFP,SA-GFP),细胞周期Fucci系统(Clover-Geminin, mKO2-SLBP)。 *动物模型:小鼠原位成瘤和皮下成瘤。
苏媛媛生物成像,在探讨生物成像探针与生物分子相互作用及揭示其理化性质与其生物行为学关系基础上,发展新型生物荧光成像探针与治疗试剂,并将其应用于生物学基础研究与疾病诊疗。 
朱亚锋肿瘤蛋白质组学,研究内容包括:(1)来自非编码区肿瘤相关/特异性抗原作为癌症疫苗激活机体抗肿瘤反应;(2)空间蛋白质组学技术解析肿瘤异质性及抗药机制;(3)基于质谱的定量蛋白质组学/蛋白翻译后修饰分析。 
廖新勤人工智能交互式可穿戴电子器件研究,致力于将新型功能材料、敏感元件及器件设计与国家战略性新兴医疗产业需求相结合。主要研究内容:(1)设计有序图案化应变敏感微结构,揭示渗流网络对器件性能的调控规律,结合柔性力学设计方法,研制具有高灵敏度的柔性和延展性应变传感器,实现对手背、手腕、手臂、指关节、肘关节、颈部关节、膝关节等部位的活动监测,发展可穿戴应变传感器在人体健康监测和康复评价领域的应用。(2)提出界面调控半导体能带结构的新方法,发展电接触理论,研制具有宽检测范围和长寿命的可穿戴压力传感器,通过对传感器机电信号进行编码和使用,将指尖的作用力转换成了可视化的力反馈,开拓可穿戴压力传感器在仿生假肢、人体增强和医疗康复机器人领域的应用。(3)提出对称/非对称分层电接触结构的新策略,解决单一信号通道无法分辨时间-空间的技术难题,通过微纳工艺和 3D打印研制感知-传输-识别一体化触摸定位传感器,通过结合人工智能算法,探索可穿戴触摸定位器件在仿生感觉神经系统、人机交互和虚拟医学训练领域的应用。(4) 提出结构设计与多效应耦合相结合的新方法,阐明应变对多功能传感器性能的调控机制,研制具有检测应变、温度、紫外光的多功能传感器,实现对心率、肌肉表皮活动、手势动作、坐姿、呼吸、环境温度、光强等方面的监测,探索可穿戴多功能传感器在人体健康监测和安全预警领域的应用。 

 

 
(图文:医研中心 2020-9-14)   

 

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